FIg3HJ [复制链接]

数据：

CCLE的LUAD的细胞RNA-seq的数据？？

20个GSE的缺氧和未缺氧的样本的基因表达矩阵。

处理：

NMF算法聚类：注意不能有na，0，或者null，可以赋予0为0.等等；

ssGSEA：

PCA：下载不了pca3d，只能用二维代替，但是效果不好；需要再学习

ggboxplot：注意均值的方法选择：anova是多组的参数，KH是多组的参数；2组是t或者U检验？

输入数据最好是长数据：变量在列，分类变量和连续变量：

比如：

？长宽数据的转换：参考如下